Základní i formální podmínky pro nárok na odpočet DPH jsou sice v posledních letech neměnné, v praxi však plátce často narazí při prokazování jejich splnění. K věcným chybám často dochází u oprav odpočtu, stanovení nároku na odpočet v poměrné výši nebo při aplikaci krátícího koeficientu. Vyrovnání a úprava odpočtu vyvolává nutnost sledování osudu majetku během delšího časového úseku, popř. povinnost jednorázové úpravy při prodeji majetku. Korekce dříve uplatněného nároku na dpočet daně pak může být výsledkem inventarizace.